Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcd2Q61285 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd2Q61285 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms