Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms