Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vdac3Q60931 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac3Q60931 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms