Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2dQ60773 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms