Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2cQ60772 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms