Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik1Q60670 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms