Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Akap4Q60662 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Akap4Q60662 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Akap4Q60662 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Akap4Q60662 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Akap4Q60662 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akap4Q60662 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akap4Q60662 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akap4Q60662 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Akap4Q60662 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akap4Q60662 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms