Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms