Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm1Q60636 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms