Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr2f1Q60632 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms