Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3aQ60520 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sin3aQ60520 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3aQ60520 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms