Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf1Q5U4C3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms