Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsr1Q5SWD9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms