Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd40Q5SUE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms