Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r223Q5SSA0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms