Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf12Q5SPL2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf12Q5SPL2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms