Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85aQ5SP85 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms