Protein–RNA interactions for Protein: Q5S006

Lrrk2, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

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Length 2,527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrk2Q5S006 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrrk2Q5S006 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrk2Q5S006 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrk2Q5S006 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrk2Q5S006 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrk2Q5S006 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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