Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms