Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf3Q5HZG4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms