Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm2Q5FW85 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm2Q5FW85 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm2Q5FW85 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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