Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms