Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms