Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam208bQ5DTT3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam208bQ5DTT3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms