Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1lQ5D525 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms