Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpjQ569L8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms