Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnl1Q52KE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms