Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms