Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otol1Q4ZJM7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms