Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xirp2Q4U4S6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xirp2Q4U4S6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms