Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shank3Q4ACU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms