Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt35Q497I4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms