Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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