Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pydc3Q3V3Q4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms