Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms