Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clpsl2Q3UW21 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms