Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms