Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpaQ3UU96 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms