Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trat1Q3UU67 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trat1Q3UU67 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trat1Q3UU67 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trat1Q3UU67 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trat1Q3UU67 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trat1Q3UU67 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trat1Q3UU67 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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