Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms