Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms