Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms