Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep63Q3UPP8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms