Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cobll1Q3UMF0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms