Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms