Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc33Q3ULW6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc33Q3ULW6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms