Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcgf5Q3UK78 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcgf5Q3UK78 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms