Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpr55Q3UJF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms