Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms