Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms